mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTCTTATATTATGAAACGGAG CCGTTTTATAATGTAAAACTTT CTCCGTTTTATAATGTAAAACTTTCTAGCATTGCCCACGTTCATTTATATGTTAATGAATCTAGATATATTTATGTGTTTAAATTCATTAACATCTATATGTATATGAGCAATGTTAGAAATTCTTATATTATGAAACGGAG 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1122 8e-40 osa-MIR819j 4e-29 -61.4 ((((((((((((((((((.(.(((((((((((((.((..(.(((.((.((((((((((((.((((((((....)))))))).)))))))))))).)).))).)..)).))))))))))))).).)))))))))))))))))) (-61.40)