mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATAT GTTGGCTCGGCTCACTCAGA ATGTTGGCTCGGCTCACTCAGACGGCATTGGCGTGATGCAAAGCATGCATGCGTGCTTGCTACCTCACTTGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATAT 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 1e-46 osa-MIR171e 8e-48 -49.5 ((((((((.(((((((.(((((.(((((....((((.((((.(((((....)))))))))....))))..)))))))))).))))))).)))))))) (-49.50)