mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAGCCTCTGCATCCAG GGGCGCAGTGGTTTATCGATC CTGGGCGCAGTGGTTTATCGATCTCTTCCCTGCCTTGTGCTGCTCCGATCGATGCCCGTGCTGATTCTTGATAATATACAACGCAGGAATCGATCGATAAGCCTCTGCATCCAG 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR162_2 5e-59 osa-MIR162b 3e-60 -46.3 ((((..((((.((((((((((((..((((.(((.(((((....((.(((((..((....)))))))...)).....))))).)))))))..)))))))))))).))))..)))) (-46.30)