mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGATAATGCCGTGAATTTG AATTCGCATGCCCTATCTTGTG CGAATTCGCATGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGCACACGATAATTTATGGTGCGTATTGGGGGCTTACAATAAGATAATGCCGTGAATTTG 3 1 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1428 3e-47 osa-MIR1428c 4e-28 -27.7 (((((((((..((..((((((((.(((.(..((.(((.(((.(((...))).))).))..).))..).))).))))))))..)).))))))))) (-27.70)