mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTGAAGTCCAATAG GGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGATGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATAAGCAGAGATTATAATTTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTGTATTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 3 0 3' arm Ricinus_communis micropc MIR159 3e-92 rco-MIR159 2e-93 -80 ((((((((((..(((((((..((((((((....((((((...(((((.(((((.((((.(..((((((.(((((...(((((.......))))).))))).))))))..).)))).))))).)))))..))))))......))))))))..)))))))..)))))))))) (-80.00)