mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAATAATAATAATAAT TGTTTTCATTAAAAATTT ATTGTTTTCATTAAAAATTTTAAAAAATATATCCTAAAATAATAATAATAATAAT 5 1 3' arm Amborella_trichopoda micropc 100 100 0 ((((((...((((...((((((............))))))..))))...)))))) ( -0.60)