mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATGACCATCAGCAAAC TTGTTGGTGGTCATTTAACC GTTTTGTTGGTGGTCATTTAACCATGCTTCCATCGATGGGTGCATGGTTTATGGCAGAGTGTGATGCCATGAACTCATCATGGTCATGCATGTGTGCATGGTTAGATGACCATCAGCAAAC 1 0 3' arm Saccharum_officinarum micropc 100 ssp-MIR827 2e-64 -62.8 ..(((((((((((((((((((((((((..((((.(((((((.((((((..((.((.....)).)))))))).))))))))))).(((....))).))))))))))))))))))))))))). (-62.80)