mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGATAATGCCGTGAATT TTCGCATGCCCTATCTTGTG AATTCGCATGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGAGCACACGATAATTTATGGTGCGTATTGGGGGCTTACAATAAGATAATGCCGTGAATT 3 1 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1428 8e-45 osa-MIR1428c 5e-27 -24.5 (((((((..((..((((((((.(((.(..((.(((.(((.(((...))).))).))..).))..).))).))))))))..)).))))))) (-24.50)