mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGTTGCTGCCTCAAGCTT GCATGAGGCAACAACTGCATT AAGCATGAGGCAACAACTGCATTACTTGCAAGAAAGGCACAAAATCATTAGATGATTACTTGTGGCTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGCTGCCTCAAGCTT 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR444 7e-21 osa-MIR444d 1e-52 -62.8 ((((.(((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...))))))..))))).))))))))))))).))))))))).))))))).)))) (-62.80)