mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAGCCTCTGCATCCA GGCGCAGTGGTTTATCGATC TGGGCGCAGTGGTTTATCGATCTCTTCCCTGCCTTGTGCTGCTCCGATCGATGCCCGTGCTGATTCTTGATAATATACAACGCAGGAATCGATCGATAAGCCTCTGCATCCA 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR162_2 7e-58 osa-MIR162b 4e-59 -43.8 .((..((((.((((((((((((..((((.(((.(((((....((.(((((..((....)))))))...)).....))))).)))))))..)))))))))))).))))..)). (-43.80)