mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCTG GGGATGAACTTGAGAACACACG CAGGGATGAACTTGAGAACACACGGCCATCATATAGCATGATTGCACACAGAAATTGTGTGTGCATAATGTGTTATTTGATTAGGCATGTGTTCTCAGGTCACCCCTG 1 1 3' arm Cryptomeria_japonica micropc MIR398 0.00009 ath-MIR398c 0.000005 -55.1 (((((.(((.((((((((((((..(((((((.((((((((..((((((((.......))))))))...)))))))).))))..))).))))))))))))))).))))) (-55.10)