mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATCGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAACA GGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGATCTAACAGGTAAGATTAAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGTCCTATCTATTATTTGATAGGATAGGTAAGTGGGTAGCATATGTCAGGAGCTACATTACCCTAAGTTGGATCGCTTATTGGATCGAAGGGAGCTCTA 4 0 3' arm Nicotiana_tabacum micropc MIR159 2e-28 sly-MIR159 2e-22 -70.6 ((((((((((...((((((..(((((((((((.(((((.....((((.(((((.((((...(((((.((((((((........)))))))).)).....)))...)))).))))).))))...)))))....)))))))).))).))))))...)))))))))). (-70.60)