mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACAGGGACGAGGTAGAGCATG AGACAGGGACGAGGTAGAGCATGGATGGAGTTCCCAACAGAACAGTCAAGCTGTTGTGGCTCCACTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT 5 0 3' arm Fragaria_vesca micropc MIR408 2.0E-14 vvi-MIR408 4.0E-9 -50.6 ...((((((.(((((((.(((((..(((((((..((((((..........)))))).)))))))..))))).))))))).))))))... (-50.60)