mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGATCGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAACAG GAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGATCTAACAGGTAAGATTAAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGTCCTATCTATTATTTGATAGGATAGGTAAGTGGGTAGCATATGTCAGGAGCTACATTACCCTAAGTTGGATCGCTTATTGGATCGAAGGGAGCTC 4 0 3' arm Nicotiana_tabacum micropc MIR159 8e-28 sly-MIR159 6e-22 -68.3 (((((((((...((((((..(((((((((((.(((((.....((((.(((((.((((...(((((.((((((((........)))))))).)).....)))...)))).))))).))))...)))))....)))))))).))).))))))...))))))))) (-68.30)