mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT GGAGTGACACTAAGAACACATA AGGAGTGACACTAAGAACACATATGGTTGAATTGCTATCTCCACTGCATATTCATATGTTGTACAGTACAAATTTTCGATGCACATACAGTTGTTTGTGAGACATTGTGTGAACCATCCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT 3 1 3' arm Lactuca_serriola micropc MIR398 0.0001 aqc-MIR398a 0.0000005 -44.49 (((.(((((.((.((((((((.((((.((................((((.........(((((...))))).......)))).((((((((.(((.....)))))))))))...)).)))).)))))))).))))))).))). (-44.49)