mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCAATCCCT GGATTGTTGTCTGGTTCAAGG CCAGGCTGAAGTTAGGTTAAGGGGATTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATTGTGCAAAATGTTCATTCATGGAGGCACAGGATGCTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCAGCATCTGCACAA GGGACTCCATCTTGGCATCTCTGAATCAGTTTGATTTTGATAGGAGTTCTTGTTTTGGAGTGCATGGCATGTCCAGGCTGAAGTTAGGTTAAGGGGATTGTTGTCTGGTTCAAGGTCTCCACATTGTGCAAAATGTTCATTCATGGAGGCACAGGATGCTTGGTGATCTCGGACCAGGCTTCAATCCCTTTAACCAGCATCTGCACAATATGTCTCTCATCCGAGTGTGGTGCACTGCTGTAACTGGAGTACCTCTTGCTTTGTTTTATCAGCATATGAACAAGCAAAGTTTAACAAAGATCTAGGTTTGCTCATCAAGAATCCAAGGGTTTGGTTCTATCTAGAAGGAAACCCTGGATAGCTAAGGACCAGTTACTCTATATAGTGTATATGTGTTTTTGTAGACAGTGAGCAGTGTATATGTGTGTCAGGCATGCCGNTCATGCGGGGAAACGCATGCTGCGAGCTTCTCATNTNCTCAG 3 0 3' arm Oryza_sativa mirnest mir-166 9e-55 osa-MIR166l 5e-62 -55.9 ....((.((.(((.((((((((((((((..(((((((((.(((((.(((..((((((...(((......)))....))))))......))).))))).)))))))))..))))))))))))))))).)).)).... (-55.9)