mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAATAGA GGGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGCCCTATCTATCAACTGAAGGATAGGTTTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 1 3' arm Populus_deltoides micropc MIR159 2e-80 ptc-MIR159a 5e-84 -67.7 (((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.((.((.((((.(.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).))..).)))).)).)).)))))..)))))))..)).)))..))))))))))))..))))))))) (-67.70)