mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCCGGGAATCCAATGCGCC TGTATTGATTTCCGGGGA TCTCCGGGAATCCAATGCGCCTTCCTCTTGAACGCCTTTCAACGCGCGTGCTGTGCGTGAAAACGCGTTTAGGAGGAAGGTGTATTGATTTCCGGGGA 0 1 5' arm Pinus_taeda micropc 100 pta-MIR949 8e-51 -66.7 ((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((((.(((((.....))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))) (-66.70)