mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGAAGATAGAGAGCACA TGCTCTTTATGCTTCTG CAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTGCAATTAGGAGTCTTGAAGCAATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTTTATGCTTCTG 0 1 5' arm Gossypium_raimondii micropc 100 gra-MIR157a 4e-43 -36.8 ((((((((((((((((((((.(((((..((((.(((((...))))).....))))..))).)).)))))))))))))).)))))) (-36.80)