mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAGAGCATGGATGGAACCA GCTCCTCCCATGCGCTGCCTC GAGACAAAAGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTTCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCGCTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTGCC CATGCGTGTACTGATTTAACATCAACACTTGTTATCTTCCTTCCTGAGCCTGAGCCTGAGCCTGAGCATTGTAGCCCAGGTAAGGTTTTTGAGGGAGTGAGAGCCGGACTCTGAGACGGCAATGGTAAGGGGGGTACGAGGTAATAATAACTCTTTGGTGTGTGCGTGAGAGAGAGGCAAGAAGCAAGAGACAAAAGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAACCATTAACAGGTTCTCTGTTTTGGCTCCTCCCATGCGCTGCCTCTTCCCTGGCTCTCTGCCTTCCTCGTCTTTTTCTCTCCATTTACTTTTTCATTTCTGTTGCCTTGCTGCTTGGCATTCATTTATTTGATGTTATCTGCAATTTTTACTGTTGTTATAACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTATATTGACATCTTTTTTGACAAATTTGTGACATTTTTCATTGCTCAAAATCTAGCAACCTCATTAAAGATCATGCAGCAGAGGATGTGAATGCGGCNATAATTATTTAATTATGGCTTCAGCCCCAGCAGCACGGCGGCCGAAATACTTTCTTGTTAAGGGCTTTCTTTTGTAACAAATTAATAAATCGTGCAGCAGATTCTTCTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCTAGTCAAATTAATAATTGTAGATCTTAAATTGTTTCAAACAACATAATAATAAAATGTATACTTCACCAGAGAAAATTTTGG 4 0 5' arm Citrus_unshiu mirnest MIR408 0.000000000000006 csi-MIR408 5e-49 -47 ((((.......(((((((.((((((.((((((..(((.(((..((((((...)))))).))).)))..)))))).)))))).)))))))..)))).... (-47)