mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGGGG GGGGAATGTTGTCTGGCTCGGGGCTACTTTTAATTTCTCTCTCTTTTGATATCTTCTTTTCTCGATCTCCTAGCTTGATCTTTTTGATCTCTCAAATCGATCTTAAGAAAAAGATCAGTCAAAGAGATGAGAGTAGATGTCTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc mir-166 9e-37 osa-MIR166b 5e-38 -64.67 ((((((((..((((((..(((((((((.....(((((((((((((((((((((((..(((((.((((.........((((.....)))).........))))...))))))))))..))).)))))).))))).))))....)))).)))))..))))))..)))))))) (-64.67)