mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTATGAAACGGAGGGAG TTCTCCGTTTCACAATGTA TTTCTCCGTTTCACAATGTAATACTTTCTAGCATTGCACATATTCATATAGATATTAATGAATCTAGGCATATATATGTGTTTAGATTCATTAACTTCTATATAAATATGGGTAGTGCTAGAAAATCCTACATTATGAAACGGAGGGAG 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1122 8e-40 osa-MIR819i 6e-28 -77 (..((((((((((.((((((....(((((((((((((.((((((.(((((((..((((((((((((((((((....))))))))))))))))))..))))))).)))))).)))))))))))))....)))))).))))))))))..). (-77.00)