mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGCTCGAG GGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTGGCTCTATCAACTCATGTTGGATCTTCTTCGATCTAATCGAATCAAACCTCTATGTTTGAGATCTGATTAGGGTTTTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCC 4 0 3' arm Brassica_rapa micropc mir-166 6e-22 aly-MIR166a 9e-33 -54.8 (((((((..((((((..(((.(((.((((((((((((..((..((((((((......))))))))....((((((......))))))))..))).))))))..))).))).)))..))))))..))))))) (-54.80)