mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAATGTGGGAAATGATAGAAT TCTAGCATTTTCCACATTCGT ATTCTAGCATTTTCCACATTCGTAATGATGTTAATGAATCTAGACATATGTATCTATCTAGATTCATTAACATCAACACGAATGTGGGAAATGATAGAAT 1 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1122 1e-31 osa-MIR809d 2e-30 -54.2 ((((((.((((((((((((((((..(((((((((((((((((((............)))))))))))))))))))..)))))))))))))))).)))))) (-54.20)