mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGATTTGCCCGG GGGCAAGATCTCTATTGGCAGA CAGGGCAAGATCTCTATTGGCAGAAAACCATTACTTAGATCTTTGCATCTCTTTCTGCATTGATTTGTAGTGAGTTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCCGG 3 1 3' arm Brassica_napus micropc mir-399 1e-28 bna-MIR399 5e-52 -49.6 ..(((((.(((((((.((((((((.(((((((((..(((((..((((........))))..))))))))))).))).)))))))).)))))))))))).. (-49.60)