mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAATCTTGATGATGCTGCA TGGCATAATCAAGATTCAC TGTGGCATAATCAAGATTCACGTGAAAAGTTGCAAATTGGTTATATAATTGATGAAATTAATGGCTGGCTATTTGAAACTCACGAGAATCTTGATGATGCTGCA 4 0 3' arm Solanum_lycopersicum micropc 100 sly-MIR172a 2e-54 -38.8 .(..((((.((((((((((.(((((...(((.(((((..(((((.(((((.....))))))))))..)...)))).)))))))).)))))))))).))))..). (-38.80)