mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCATGTAATCAGATCATTCATTCATTCGTTGTCGTTGATGGTGCTGCATATATACGAGTACGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Gossypium_hirsutum micropc MIR396 0.0000004 ghr-MIR396a 7e-61 -42 ((((((((((((.((((((((((((...(((((....((....))............((((..(((......)))....)))).))))).)))))))))))).)))))))))))) (-42.00)