mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGCGAGTTGGCCCGCTTGC AAGCGGGTCAACCCGTGAACC GCAAGCGGGTCAACCCGTGAACCCGCTTATAGGCAAAATTAGTAGGTAACCCGTATAAATGAGTTTATGGATCGACCCACTTGCATCTCTAAGTGCGGCAAATCGGACCACGACGTGAAAACACACGGGTTATCACTTATTTTACATATAAGTAGGTTTGCGAGTTGGCCCGCTTGC 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc 100 osa-MIR1431 1e-97 -82.1 ((((((((((((((.((..((((..((((((.(.(((((.(((.((((((((((.............(((.((((((((((((......)))))).))....)))).)))....((....))..))))))))))))).))))).).))))))..))))..)).)))))))))))))) (-82.10)