mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCGTGCCAATATCACA GATGTTGGCATGGTTCAATCAAACCGGGCAAACTTATGCACTAGCTAAGCAAGATGCAGGGATATGCAGTATGGTTTTGTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACA 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 1e-56 osa-MIR171f 6e-58 -56.4 (((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((....((...))....((((......)))))))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))... (-56.40)