mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCC AGCTCCCTTCGATCCAATC GAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGTTGCAGCTGCCGGTTCATGGATGCCTCTCTGGTGCAGCAATGACTAATGCTCACCTGCACTTGCATGGGTGTGCATGACCCGGGAGATGAACCCACCATCATCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTCC 1 0 3' arm Saccharum_officinarum micropc MIR159 1e-91 sof-MIR159c 3e-95 -98.4 ((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((((.((.((.((((.(((((.((((((....(((((((...((((....).))).))))))).....)))))).))))).)))).)).)))))).))))....))))))))).)).)))))))))))))))))). (-98.40)