mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCGAAA TGGGACGGAGGGAGTG TACTCCCTCCGTCCGAAAAGTGAATCTAGCCTCTGTATGTGACACATTATAGTACAACGAATGTGGATAGAAATATGTGTAGATTCGTAGTACTAGGATNTGTCGCATCGAGTNTTGGTTTTTTATGGGACGGAGGGAGTG 2 0 5' arm Oryza_sativa micropc MIR1122 6e-19 100 -64.3 ((((((((((((((.(.(((.(((((....(((.(.((((((((.(((.((((((.((((((.((.(((......))).)).)))))).)))))).))).))))))))))))....)))))))).).)))))))))))))) (-64.30)