mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTTCCTTCACCCACTC GAGAGCTTCCTTCACCCACTCATGGAGGAGAACTGGGGTTGAATTAGCTGCCGCCTCATTCATCCAACCACTCAGTAGAAAGGAATAGGTTTTGTGCTACTGTGATTGAGTGAATGATGCGGGAGATAGTTTTCTATTCCTCTCTTTCCTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCC 3 1 3' arm Nicotiana_tabacum micropc MIR159 1e-17 ptc-MIR319f 6e-19 -73.1 ..((((((((((((.(((..((.((((((((...(((((.((((((.((.((((.(((((((..(((.(((..(((((...((((....))))...)))))))).)))..))))))).)))).)).))))))...))))))))).)))).))..)))..)))))))))))). (-73.10)