mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACGGGGAACAGGCAGAGCATG AGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTACTAACAGAAGTACTTGTTTTGGCTCTACCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT 5 0 3' arm Populus_nigra micropc MIR408 7e-42 ptc-MIR408 4e-43 -49.2 ...(((((((.((((((.((((((.((((((((..(((((......))))).)))))))).)))))).)))))).)))))))... (-49.20)