mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGACACTAAGAACACATA AGGAGTGACACTAAGAACACATATGGTTGAATTGCTATCTCCACTGCATATTCATATGTTGTACAGTACAAATTTTCGATGCACATACAGTTGTTTGTGAGACATTGTGTGAACCATCCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCT 2 1 3' arm Lactuca_serriola micropc MIR398 0.0005 aqc-MIR398a 0.000002 -44.39 (((.(((((.((.((((((((.((((.((................((((.........(((((...))))).......)))).((((((((.(((.....)))))))))))...)).)))).)))))))).))))))).))) (-44.39)