mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACA GATGTTGGCATGGTTCAATCAAACCGGGCAAACTTATGCACTAGCTAAGCAAGATGCAGGGATACGCAGTATGGTTTTGTTTGGTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCACA 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 3e-54 osa-MIR171f 2e-55 -54.7 (((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((.....((..((.....))..)).......)))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))... (-54.70)