mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTCCC GAGCTTTCTTCGGTCCACTCA GGGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCC 4 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 6e-72 ath-MIR319b 3e-73 -73.64 (((((((..((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..))))))))))..))))))) (-73.64)