mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTCTAAGAGGAGCAGCTCGAAGCCTCGAACTCTACCTGCATGAGCAGGTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Saccharum_officinarum micropc MIR396 1e-28 ssp-MIR396 5e-49 -48.1 ((((((((((((.(((((((((((((((..((((((.((.((((....)))).)))).))).)...)).))))))))))))).)))))))))))) (-48.10)