mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTAAGTCATTCTAACATTT ATGCTAGAATGACTTACGTTG ATTTCACAATGCCATTTCACAATGTAAGTCATTCTAACATTTCCCACATTCATATTTATGTAGTAGATTCATTAACATCAATATGAATATGAGAAATGCTAGAAACATTTCCCACATTCATATTTATGTTAATGAATCTAGATAGATACATTAACATCAATATGAATATGAGAAATGCTAGAATGACTTACGTTGTGAACCGGAGGGAGTATA CCTTTTTTCTGAACAACCATTTTCCTAACTCGTACAAAGTACTTCCTCCATTTCACAATGCCATTTCACAATGTAAGTCATTCTAACATTTCCCACATTCATATTTATGTAGTAGATTCATTAACATCAATATGAATATGAGAAATGCTAGAAACATTTCCCACATTCATATTTATGTTAATGAATCTAGATAGATACATTAACATCAATATGAATATGAGAAATGCTAGAATGACTTACGTTGTGAACCGGAGGGAGTATATACACACAAGCCATTCGGAAGGTCCTGCTGAATCCTAAACCATCCGCAAGTACGGAGGAGGGTGTCAAGGCTGAAGGTCATACTCCGACATTAGAAAAAAATCGAGTACTAACAGAAAAGGTTCCAATAAGCACGCTGGATATTGCCCTTCAAAGTTCAAACCAACACTTCAGCATGGTTCTTCTTTCCTTGACCAGAACAAGTGTAGCGAAGAACAAAAACGCATTCAACAACAGGCAATCTGCATAAACTTATACATCATGTTTTCTTTGTTGCCCATTGAGAGGCACTCAGCATATGGTACATCATCCAAATTGCCGGTCAACAAGAAAACAAAACCCTCAACCTCGGCACACGCGACAGTGTCTTTCGTCCTACTATCTTCAAAGAATATATCTTGCACCGGACAAAACTATATCCTTCCACGTATAGGGAGCCTGACATTTATATCCTTCATGTTAGCATTTGATGTTGGTGTTAGTGTTCAGGCAGGCTCGAGACCATATCATGTCAACCAAGATTGGTTGATGTCCCACTCCCAAACAATGCATTGTCTGCTGTTCAAGCT 1 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 1e-30 osa-MIR809b 9e-28 -79.9 (((((......((..(((((((((((((((((((((.((((((.((.(((((((((.((((..(((((((((((((((.(((((((((.((.((((((.......)))))).)).))))))))).)))))))))))))))(((......))).)))).))))))))).)).)))))).)))))))))))))))))))))..))..)))))... (-79.9)