mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGTACGTGC ACGTGCTCCCCTTCTCCA TGGAGAAGCAGGGTACGTGCAAAATGCACACCGGTTGGTCGAGCTAATTAACAAGCTCTGACGACCATGGTGATCGAATGCACGTGCTCCCCTTCTCCA 3 0 5' arm Oryza_sativa micropc MIR164 4e-50 osa-MIR164c 2e-51 -48.72 .(((((((..(((((((((((.......(((((((((.(((((((........))))).)))))))..))))......)))))))))))..))))))). (-48.72)