mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGATTTGCCC GCAAGATCTCTATTGGCAGA GGGCAAGATCTCTATTGGCAGAAAACCATTACTTAGATCTTTGCATCTCTTTCTGCATTGATTTGTAGTGAGTTCTCTGCCAAAGGAGATTTGCCC 1 1 3' arm Brassica_napus micropc mir-399 2e-27 bna-MIR399 1e-49 -47.7 (((((.(((((((.((((((((.(((((((((..(((((..((((........))))..))))))))))).))).)))))))).)))))))))))) (-47.70)