mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTTTCTTCGGTCCACTCA GGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCC 4 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 2e-71 ath-MIR319b 1e-72 -70.34 ((((((..((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..))))))))))..)))))) (-70.34)