mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTGCCTCAAGCTTGCTGC ACCAAGCATGAGGCAACAACT GCACCAAGCATGAGGCAACAACTGCATTACTTGCAAGAAAGGCACAAAATCATTAGATGATTACTTGTGGCTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGC 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR444 8e-24 osa-MIR444d 2e-58 -69.8 (((.(((((.(((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((((((...))))))..))))).))))))))))))).))))))))).))))))).))))).))) (-69.80)