mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCTGGCTCCCTGCATGCCA GCGTGCAAGGAGCCAAGC GCCTGGCTCCCTGCATGCCACTCATGTAGCCCAATCCATGGTGTGTTTGGATGCTGTGGGTGGCGTGCAAGGAGCCAAGC 2 0 5' arm Oryza_sativa micropc mir-160 2e-36 osa-MIR160b 9e-38 -47.9 ((.(((((((.((((((((((((((..(((...(((((.........)))))))))))))))))))))).))))))).)) (-47.90)