mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGTTGTTGCCTCAAGCTT GCATGAGGCAGGAACTGCATT AAGCATGAGGCAGGAACTGCATTACTTGCAAGAAAGTCACAAAATCAATTGCAGGACATACTTGTGGTTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGTTGCCTCAAGCTT 2 0 3' arm Saccharum_officinarum micropc MIR444 3e-32 ssp-MIR444a 9e-54 -56.41 ((((.((((((((.((((((((.((((((((((((..(((((...................)))))..)))))))))))).)))))))).)))))))).)))) (-56.41)