mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTTTCTTCAGTCCACTT GAGCTTTCTTCAGTCCACTTATGGGTGACAATAAGATTTCAATTAGCTGCCGACTCATTCATCCAAATGCTGAGTGAAAGCGAAGAAAGATACTCAGCAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGATTCTTAAGTGTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCC 4 0 3' arm Glycine_max micropc MIR159 3e-49 gma-MIR319b 9e-89 -76.4 (((((..((((((((((..((((((..(((.(((((..((((((.(((.(((..(((((((..((..(((((((((....(.......).)))))))))..))..)))))))..))).)).).)))))).)))))..)))))))))..))))))))))..))))). (-76.40)