mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCCTTCGATCCAATC GAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGTTGCAGCTGCCGGTTCATGGATGCCTCTCTGGTGCAGCAATGACTAATGCTCACCTGCACTTGCATGGGTGTGCATGACCCGGGAGATGAACCCACCATCATCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTC 0 0 3' arm Saccharum_officinarum micropc MIR159 5e-91 sof-MIR159c 1e-94 -97.6 ((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((((.((.((.((((.(((((.((((((....(((((((...((((....).))).))))))).....)))))).))))).)))).)).)))))).))))....))))))))).)).)))))))))))))))))) (-97.60)