mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTATAGTTCAAACG GGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTGGTAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTC 1 0 3' arm Raphanus_raphanistrum_subsp__raphanistrum micropc MIR159 3e-58 bra-MIR159a 3e-73 -68.5 (((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((...((...(((((.........)))))...))...)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))).))))))))) (-68.50)