mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACGGGGAACAGGCAGAGCATG AGACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTACTAACAGAAGTACATGTTTTGGCTCTACCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCT 5 0 3' arm Populus_trichocarpa_x_Populus_deltoides micropc MIR408 2e-39 ptc-MIR408 1e-40 -49 ...(((((((.((((((.((((((.((((((((..((((........)))).)))))))).)))))).)))))).)))))))... (-49.00)