mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTAAAGTCCAATA GGAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTTTTCAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 0 3' arm Manihot_esculenta micropc MIR159 2e-25 rco-MIR159 1e-26 -84.1 ((((((((((..(((((((..((((((((.(((((((((...(((((.(.(((.((((.(..((((((.(((((((.........((((((..(((......))).))))))))))))).))))))..).)))).))).).)))))..)))))).....))).))))))))..)))))))..)))))))))) (-84.10)