mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTGAAGTCCAACA GGAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 0 3' arm Solanum_lycopersicum micropc MIR159 1e-88 sly-MIR159 3e-92 -74.2 ((((((((((..(((((((.(((..(((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((((..((((........)))))))))))).))).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))..))).)))))))..)))))))))) (-74.20)